单细胞测序服务
多模态单细胞组学检测服务
单细胞测序技术
生物学研究的核心对象是细胞——生命活动的基本功能单元。长期以来,传统测序技术只能提供细胞群体的“平均”分子读数,掩盖了细胞之间的个体差异。单细胞测序技术的出现,将生物学研究的分辨率推进至真正的单细胞层面,使在复杂组织中系统鉴定细胞类型、重建分化轨迹、捕捉细胞状态动态转换成为可能。
该技术从转录组定量出发,迅速拓展为覆盖基因组、表观基因组、免疫组库和空间信息的全景式观测体系。研究者可在同一实验中获取多维度分子信息,在细胞尺度上理解基因调控逻辑、免疫应答谱系结构及疾病微环境中的细胞互作网络。
我们基于10x Genomics、墨卓等平台,提供覆盖转录组、表观基因组和免疫组库的单细胞测序服务,涵盖从样本制备、文库构建到数据分析的完整工作流。
服务类型
3' 转录组测序
针对mRNA 3'端进行捕获与测序,在全转录组范围内定量基因表达水平,适用于细胞分群、细胞类型鉴定、差异表达分析和分化轨迹推断。支持单细胞(scRNA-seq)和单细胞核(snRNA-seq)两种输入模式,适用于新鲜样本及难以解离的组织样本。
5' 转录组 + 免疫组库测序
在捕获全转录组信息的同时,通过5'端富集策略获取T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的全长V(D)J序列,支持在同一实验中同步分析基因表达谱与免疫受体克隆型,适用于免疫学研究中的T细胞/B细胞功能解析、疫苗应答评估和肿瘤免疫微环境分析。
ATAC-seq(单细胞染色质可及性分析)
利用Tn5转座酶在开放染色质区域优先插入测序接头,在单细胞分辨率下绘制全基因组染色质可及性图谱,识别调控元件(启动子、增强子)及其在不同细胞类型中的开放状态,适用于转录调控机制研究和细胞异质性的表观遗传学解析。
Multiome(转录组 + 染色质可及性联合分析)
在同一单细胞核中同时捕获基因表达(mRNA)和染色质可及性(ATAC)数据,实现转录组与表观基因组层面的直接关联分析——无需计算层面的数据整合或批次校正即可在单个细胞分辨率下建立基因表达与染色质状态之间的对应关系。
表面蛋白组学(Feature Barcoding)
利用寡核苷酸标记抗体(Oligo-conjugated Antibodies)在单细胞转录组测序的同时定量检测数十种细胞表面蛋白的表达水平,通过多模态数据(转录组 + 蛋白组)实现更精确的细胞亚群划分和功能状态注释。
技术应用
- 细胞图谱与细胞异质性解析 在组织或器官尺度系统鉴定细胞类型与亚群,构建正常与疾病状态下的细胞参考图谱。
- 肿瘤微环境研究 解析肿瘤浸润免疫细胞的功能状态、克隆动态和细胞间互作网络,揭示免疫逃逸与治疗响应的细胞基础。
- 发育生物学与分化轨迹 追踪干细胞分化、组织再生和器官发育过程中的细胞状态转变路径,识别关键的转录调控节点。
- 免疫组库与疫苗研发 分析TCR/BCR克隆多样性与抗原特异性免疫应答的分子特征,评估疫苗和免疫治疗策略的免疫学效应。
- 药物作用机制与耐药性 在单细胞分辨率下解析药物处理后细胞群体的转录重编程,识别稀有耐药细胞亚群及其分子特征。
- 神经科学 解析脑区特异性细胞类型、突触可塑性和神经退行性疾病中的细胞选择性易感性。
服务流程
核心能力
- 多组学覆盖 在单细胞层面同时支持转录组、表观基因组、免疫组库和表面蛋白分析,可从同一批样本出发实现跨组学的数据关联,减少批次效应。
- 全流程实验支持 配备标准的单细胞前处理与质量控制流程,支持包括实体组织、血液、冷冻样本和细胞核在内的多种样本类型的实验方案优化。
- 生信分析体系 分析流程覆盖单细胞数据处理的各关键环节——从原始数据的质控与比对,到降维聚类、差异表达分析、富集分析、拟时序分析和细胞通讯分析,输出完整的分析与可视化结果。
- 定制化分析能力 在标准交付的基础上,可根据研究需要开展个性化的深度挖掘,包括但不限于基因调控网络推断、转录因子活性分析、空间位置映射推断等。
具体方案需技术沟通确认。